马鞭石斛对半乳糖所致的自内障晶状体中醛糖还原酶、多元醇脱氢酶的活性异常变化有抑制或纠正作用；石斛多糖具有增强T细胞及巨噬细胞免疫活性的作用；能显著提高超氧化物歧化酶（SOD）水平，从而起到降低脂质过氧化物（LPO）的作用，马鞭石斛的有效成分主要是石斛多糖和生物碱，其中多糖由于具有抗氧化、免疫增强和抗癌功效作用，而成为近几年科学研究的热点。2000年版和2005年版《中国药典》收载马鞭石斛。马鞭石斛的干燥茎是药用石斛主要品种之一，每年在各大药材市场交易量巨大，药厂通常将石斛搭配其他药材制成肾药、为药、脾药、肠胃药等。

马鞭石斛的药用成分有菲类（鼓槌菲、毛兰菲、流苏菲）、联苄类（鼓槌石斛素、鼓槌联苄、毛兰素、玫瑰石斛素等）、大黄素型蒽醌类（大黄素甲醚、芦荟大黄素、大黄酚、大黄酸等）、香豆素类（滨嵩内酯和泽兰内酯），此外还有少量的草酸等。现在很多的药店都用马鞭石斛来进行入药，而且马鞭石斛经常被拿来制作成膏药，在治疗风湿和脾胃上面效果甚好。

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